本课题组的研究领域主要定位为污染控制和环境生物技术，具体分为2个方向：

(1)  污染物风险评估及控制

(a) 饮用水水质风险评估和控制技术

涉及生物稳定性、黄水问题相关微生物、致病微生物、抗性基因和耐药菌、碳氮循环和污染物降解等。

(b) 新污染物高效生物去除技术

涉及新污染物的生态风险评估、以及降解功能菌的DNA-SIP识别、富集培养、分离、筛选、菌剂研发和强化处理应用。

(2)元素生物地球化学循环和温室气体控制

涉及红树林、湖库、河流、天然与人工湿地、土壤系统中碳、氮、硫循环功能微生物（尤其温室气体相关的功能微生物）分布特征及影响因素（包括有毒污染物）、以及病毒对元素循环的调控过程和机制