主要通过化学生物学、高通量测序、结构生物学等手段，对核酸修饰的生物功能及其生理调控机制进行研究。一方面，核酸的化学修饰对许多重要生命过程（比如5-甲基胞嘧啶及其氧化产物对基因表达及细胞发育过程、RNA编辑对选择性剪接及蛋白质翻译过程等等）都有着广泛而深远的影响；另一方面，异常的核酸修饰（比如DNA及RNA损伤）则会导致细胞衰老、死亡及致癌性变异等严重后果。因此，我们将通过灵敏、高效的检测手段的建立，对许多核酸修饰的产生及调控过程进行研究，并对其生物功能进行阐述。具体的研究内容包括：（1）以核酸修饰为机理的表观遗传学；（2）新颖RNA修饰对小分子RNA（microRNA）及长链非编码RNA（lincRNA）功能的影响及机理；（3）碱基切除及核苷酸切除DNA修复通路在防止细胞衰老及癌变过程中的分子机制。