李程于1995年毕业于北京师范大学数学系，获得计算机学士学位。2001年毕业于美国加州大学洛杉矶分校统计系，获得统计学博士学位。2002至2013年在哈佛大学生物统计系、Dana-Farber Cancer Institute作为助理教授、副教授从事研究与教学工作。研究组开发的dChip、ComBat系列数据分析算法和软件被广泛应用于基因表达和SNP生物芯片的数据分析和可视化，文章被引用3000余次。研究组的工作获得多项美国国家卫生院基金资助，在Nature, PNAS, Blood,Leukemia, Cancer Research, Bioinformatics 等刊物上发表论文95篇，一共被引用20,000次以上，H-index 为46。2013年4月全职加入北京大学生命科学学院、生命科学联合中心、生物信息中心、统计科学中心。实验室使用生物、统计、计算等跨学科手段，提倡并培养研究人员和学生的科研技能与合作精神。多名承担过实验室项目的学生毕业后在美国知名大学任教。